Tietopyyntö: suuren kapasiteetin NGS/rinnakkaissekvensointilaite

Tietopyyntö: suuren kapasiteetin NGS/rinnakkaissekvensointilaite Tämä ei ole hankintailmoitus eikä tarjouspyyntö, vaan tietopyyntö mahdollisille tarjoajille. Tämä ilmoitus on kutsu markkinavuoropuheluun, jonka tarkoituksena on kartoittaa markkinoilla toimivien toimittajien ratkaisuvaihtoehtoja sekä näiden ratkaisuiden hinta-arvioita. Tässä tietopyynnössä annetut tiedot ja vastaukset eivät sido niiden antajaa. Vasta mahdollisen tarjouspyynnön perusteella annetussa tarjouksessa ilmoitetut tiedot ovat tarjoajaa sitovia. Tämä ilmoitus ei velvoita hankintayksikköä toteuttamaan hankintaa. Hankintayksikkö ei korvaa mahdollisia kustannuksia, jotka aiheutuvat markkinavuoropuheluun osallistumisesta. Saatuja vastauksia käsitellään luottamuksellisesti. Vastausten yhteydessä pyydetään ilmoittamaan niiden mahdollisesti sisältämät liikesalaisuustiedot, jotka käsitellään luottamuksellisesti. Viranomaiselle toimitettujen tietojen ja asiakirjojen julkisuuteen sovelletaan lakia viranomaisen toiminnan julkisuudesta (21.5.1999/621). Varsinais-Suomen hyvinvointialue kartoittaa markkinatilannetta suuren kapasiteetin NGS / rinnakkaissekvensointilaitteista, joita käytetään potilasdiagnostiikassa DNA- ja RNA-pohjaisissa sekvensointitutkimuksissa. Sekvensaattoria tullaan käyttämään perinnöllisten ja somaattisten DNA- ja RNA -näytteiden diagnostisessa testauksessa kattaen koko eksomin- ja koko genomin laajuiset tutkimukset. Hankittavalla sekvensaattorilla pitää pystyä ajamaan kirjastoja lyhyen readin (short read) -teknologialla sekä etäisyyskartoitukseen perustuvalla teknologialla (tuottaa informaatiota pidemmiltä genomin alueilta). Sekvensaattorilla ajettavien kirjastojen valmistuksessa tulee voida käyttää laboratoriossa tällä hetkellä käytössä olevilla DNA-eristysmenetelmillä eristettyjä näytteitä. Sekvensaattorin tulee toimia varalaitteena jo laboratoriossa oleville sekvensaattoreille ilman laajamittaista validointia. Laitteen tulee olla kapasiteetiltaan joustava siten, että rutiinidiagnostiikassa voidaan tarpeen mukaan sekvensoida sekä pienempiä näytesarjoja (korkeintaan 12 näytettä) sekä suuria koko genomin näytesarjoja (vähintään 48 näytettä). Laitteen ehdottomat vaatimukset: 1. Laitteen pitää toimia varalaitteena laboratoriossa käytössä oleville laitteille, eli sen sekvensointikemian tulee olla laboratoriossa jo käytössä olevia laitteita vastaava. 2. Laitteessa tulee myös olla vaihtoehtona automatisoitu kirjastonvalmistelu, sekvensointi ja bioinformatiikka pakettina, mahdollistaen pitkät haploblokit sekä pseudogeenialueiden analyysit geenikohtaisilla algoritmeilla. 3. Laitteella ajettavien kirjastojen valmistuksessa tulee voida käyttää laboratoriossa tällä hetkellä käytössä olevilla DNA-eristysmenetelmillä eristettyjä näytteitä. 4. Laitteen kapasiteetin tulee olla joustava siten, että laitteessa voidaan käyttää vähintään neljän kokoluokan ajokasetteja näytesarjojen koon mukaan. Pyydämme liittämään vastaukseen esitteen ehdotetusta laitteesta sekä alustavan, ei sitovan, hinta-arvionne ehdotetulle laitteelle/kokonaisuudelle. Pyydämme liittämään vastaukseen esitteen ehdottamastanne laitteesta sekä alustavan, ei sitovan, hinta-arvionne ehdotetulle laitteelle/kokonaisuudelle. Voitte liittää vastaukseenne myös esitteitä.,